Bei kleinen, voll gestillten Kindern bis 3 Monate kann man ca. 15 – 20 Minuten nach dem Stillen mit der Therapie beginnen; bei größeren Kindern, die bereits festere Nahrung bekommen, sollte man besser 30 Minuten warten. Die Vojta-Methodik hat einen deutlichen Einfluss auf den ganzen Verdauungssystem, denn sie normalisiert den Muskeltonus der glatten Muskulatur in der Magen- und Darmwand. Dadurch fördert sie die Bewegung der Nahrung im Verdauungssystem, und folglich wird auch das Entleeren verbessert. Die Tendenz kleiner Kinder am Anfang der Therapie geringe Milchmengen zu erbrechen, verschwindet relativ schnell dank des o. a. Einflusses.